Ist bei mir noch nicht aufgetreten, daß Battle.net alle Spiele verliert.
Sofern das aber nicht bei jedem Battle.net Neustart auftritt, kann man auch einfach mal mit den Schultern zucken und die Verzeichnisse neu zuordnen.
Wenn man seine Spiele auf der Festplatte logisch organisiert, dauern die paar Klicks ja nicht die Welt.
Den Link zum Support Bereich von Diablo 3, sowie für alle anderen Battle.net (2.0) Spiele findest du hier:
Evtl. blockiert da was von Seiten der Sicherheitssoftware oder vielleicht fehlen Zugriffsrechte von Windows (nur mal so auf die Schnelle geraten).