Когда используешь прилив сил и затем тайный ход, все карты с прилива сил остаются в руке - это так и должно работать?
Описание прилива сил - “в конце ход сбрасывает карты неиспользованные”.
Тайного хода - “На следующем ходу заменяет их обратно”.
Но карты он заменяет так же - в конце хода, а не на следующий.
Это баг получается?
Сброс в конце хода - это дебаф на карте. Любое замешивание всегда снимает с карт все бафы и дебафы.
Все работает так, как и должно.
По механике всё верно, но очень уж она бредовая 
Верно но и верно ещё и то что сброс (как механика) происходит только из руки… то есть пока эти карты не находятся в руке (а где-то в… хм…хм… в пустоверти пустоты) то и сброс произойти не может!
Под следующим ходом подразумевается ход противника ведь вполне очевидно что следующий ход за твоим это ход противника! 
В игре очень много различных и не очевидных механик/взаимодействий которые надо держать самому в голове!
Нет это штатная механика. Так как на момент окончания хода карт с прилива в руке нет. А карты которые возвращаются из тайного хода уже не имеют дебафа на сброс.